重要的病原之一为，球虫病：要及时清理粪便，切断传染源，同时定期使用球安泰或球必妥，连用3-5天。这是芦花鸡苗的很好措施。
还有慢呼：在免疫、转群、气候突变等应激情况下，注意用肠道和呼吸道类药同时使用预防，如复方阿奇霉素或喘速治等呼吸道药3-5天。预防慢呼和大肠杆菌，有呼吸道较严重的使用肠道和呼吸道类药同时使用，如呼毒速克或复方阿奇霉素饮水，连用3-5天。
不可以小看的法氏囊：在操作免疫程序的同时在易感期使用速效囊炎净或复方黄芪多糖等抗病毒的药饮水，连用3-5天。